Η τοποθεσία των σύγχρονων τριών καμπανων έχει καταληφθεί από πολλά άλλα κτίρια. Στα μέσα του 17ου αιώνα, δύο μικρές εκκλησίες σπηλαίων χτίστηκαν στην τότε στερεά γκρεμό. Αυτές οι εκκλησίες καταστράφηκαν τελικά καθώς ο γκρεμός υποχώρησε (λόγω της συνεχιζόμενης επέκτασης των Φηρών) και χτίστηκε ένα ιατρείο.

Αυτό το κτίριο καταλήφθηκε τελικά από μοναχούς Ιησουιτών, οι οποίοι ζούσαν στο χώρο μέχρι την παραχώρηση της γης στην Επισκοπή της Σαντορίνης. Η σημερινή εκκλησία χτίστηκε το 1757 και ανακαινίστηκε και επεκτάθηκε πολλές φορές κατά τη διάρκεια των αιώνων. Η κατασκευή υπέστη σοβαρές ζημιές στο σεισμό της Αμοργού το 1956, μετά τον οποίο αποκαταστάθηκε το κτίριο. Η γιορτή της εκκλησίας είναι στις 15 Αυγούστου